种头发手术可能存在感染、毛囊损伤、瘢痕形成、术后肿胀、毛发生长不良等危害。植发手术属于有创操作，需选择正规医疗机构降低风险。
感染是植发术后较常见的并发症，手术过程中若消毒不严格或术后护理不当，可能引发局部红肿、疼痛甚至化脓。轻度感染可通过碘伏消毒和抗生素软膏控制，严重者需口服头孢克肟片等药物。
毛囊损伤多因操作者技术不熟练导致，提取或植入毛囊时力度不当会造成毛囊结构破坏，影响毛囊存活率。受损毛囊无法再生新发，可能导致移植区域毛发稀疏。选择经验丰富的医生可减少此类风险。
瘢痕体质者术后可能在取发区形成条状瘢痕或点状瘢痕，FUT技术留下的线性瘢痕更为明显。瘢痕增生期可外用复方肝素钠尿囊素凝胶，但完全消除较困难。
术后3天内多数人会出现前额、眼周水肿，与麻醉药物渗透和局部血液循环改变有关。冰敷和头高位睡眠能缓解症状，通常1周内自行消退。
部分人移植后毛发存活率低于预期，新生毛发可能细软卷曲。这与毛囊适应期、供体毛发质量有关，6-12个月后效果稳定者可考虑二次加密移植。
植发术后需保持头皮清洁干燥，避免抓挠移植区，1周内禁止剧烈运动。饮食宜清淡，补充蛋白质和维生素促进毛囊修复，避免辛辣刺激食物。术后1个月避免暴晒，按医嘱使用米诺地尔酊等生发药物。定期复查评估毛囊存活情况，发现异常渗液或持续疼痛应及时就医。选择正规机构时需确认医生资质和手术室无菌条件，术前充分沟通预期效果和可能风险。