割包皮手术在规范操作下通常安全性较高，但可能存在的短期危害包括术后疼痛、局部水肿、出血或感染，极少数情况下可能出现瘢痕增生或包皮过短。
术后疼痛是割包皮后最常见的短期不适，通常由手术创伤和神经末梢暴露引起，疼痛程度因人而异，一般3-5天可缓解。局部水肿多因淋巴回流暂时受阻导致，表现为阴茎前端肿胀，多数在1-2周内自行消退。出血通常为毛细血管渗血，术中规范止血后发生率较低，若术后剧烈活动可能增加出血风险。感染与术后护理不当有关，表现为切口红肿渗液，需及时就医处理。
瘢痕增生与个体体质相关，表现为切口处硬结或隆起，可通过局部药物注射改善。包皮过短属于手术并发症，可能因切除过多皮肤导致勃起受限，需二次手术矫正。术前充分评估阴茎发育状态、选择经验丰富的医师可降低此类风险。术后严格遵循医嘱保持切口清洁干燥、避免剧烈运动有助于减少并发症发生。
术后应穿着宽松棉质内裤减少摩擦，每日用生理盐水清洁切口并保持干燥，2周内避免沐浴露直接接触伤口。饮食宜清淡富含优质蛋白如鱼肉、鸡蛋促进愈合，避免辛辣刺激食物。术后1个月内禁止性生活及剧烈运动，定期复查观察愈合情况。若出现持续发热、切口流脓或异常疼痛需立即就医。儿童患者家长需注意观察排尿情况，避免患儿抓挠伤口。