喝咖啡一般不会直接导致月经停止，但过量摄入咖啡因可能干扰内分泌平衡，进而影响月经周期。月经异常可能与咖啡因敏感、激素水平波动或潜在妇科疾病有关。
咖啡因通过刺激中枢神经系统增加皮质醇分泌，长期过量可能抑制促性腺激素释放，干扰卵巢功能。每日摄入超过400毫克咖啡因时，部分女性会出现经期延迟或经量减少，尤其本身存在多囊卵巢综合征、甲状腺功能异常者更易受影响。咖啡因的利尿作用可能加重经前期的镁流失，镁缺乏与痛经、经期紊乱存在关联。月经周期改变还可能与饮用咖啡时伴随的应激、睡眠不足等综合因素相关。
极少数女性对咖啡因代谢能力极弱，少量摄入即可能出现明显激素波动。存在子宫内膜异位症、垂体微腺瘤等疾病时，咖啡因可能加剧原有的内分泌紊乱。部分速溶咖啡中的植脂末含反式脂肪酸，长期摄入可能通过炎症反应间接影响生殖健康。
出现月经异常建议记录每日咖啡因摄入来源及量，包括咖啡、茶、巧克力等食物。可尝试暂停摄入咖啡因2-3个月经周期观察变化，同时排查贫血、甲状腺功能异常等情况。日常注意补充富含维生素B族的全谷物、深绿色蔬菜，有助于肝脏代谢咖啡因。若停用咖啡因后仍持续闭经超过3个月，需进行妇科超声及性激素六项检查。