尿结石碎石后仍感到疼痛可能与结石未完全排出、输尿管痉挛或继发感染有关。碎石治疗通常能有效击碎结石，但残余碎片可能刺激尿路或引发炎症反应。
碎石后结石碎片在排出过程中可能划伤输尿管或膀胱黏膜，导致持续性疼痛。较小的结石颗粒可能堆积在输尿管狭窄处形成梗阻，引发肾绞痛。部分患者因碎石过程中组织损伤出现局部水肿，压迫神经末梢产生疼痛感。尿路感染时细菌刺激尿路上皮会加重灼痛感，可能伴随尿频尿急症状。碎石后未及时增加饮水量可能导致结晶重新聚集，造成二次阻塞。
建议每日饮水2000毫升以上促进残石排出，避免高草酸食物如菠菜可减少结晶形成。出现发热或血尿需立即复查泌尿系统超声，必要时使用头孢克肟片控制感染。适当服用坦索罗辛缓释胶囊有助于扩张输尿管，双氯芬酸钠栓可短期缓解绞痛症状。术后两周内避免剧烈运动防止残留结石移位，定期复查确认结石清除情况。