微创手术主要通过经皮肾镜取石术、输尿管软镜碎石术等方式治疗肾结石，具有创伤小、恢复快的特点。
经皮肾镜取石术是在腰部建立直径约5毫米的通道，通过肾镜直接观察结石位置，采用激光或气压弹道将结石击碎后取出。该术式适用于直径超过20毫米的肾盂结石或鹿角形结石，术前需通过超声或CT精确定位，术中配合X线透视确保操作安全。术后需留置肾造瘘管1-3天，可能出现血尿、发热等短期并发症。
输尿管软镜碎石术通过自然腔道进入，经尿道置入可弯曲的输尿管镜抵达肾盂，利用钬激光将结石粉碎成微粒。这种方法适合10-20毫米的中等大小结石，特别是位于肾下盏的结石，无须体表切口。术中需持续灌注生理盐水保持视野清晰，术后可能发生输尿管黏膜损伤或感染。两种术式均需结合患者结石大小、位置及肾功能状况综合选择，必要时可联合使用以提高清石率。
术后应保持每日饮水量2000-3000毫升，限制高草酸食物摄入，定期复查泌尿系超声监测结石复发情况。出现持续腰痛、血尿或发热时需及时返院检查，长期预防可遵医嘱使用枸橼酸钾颗粒等药物调节尿液酸碱度。建议结石成分分析后针对性调整饮食结构，适当增加柑橘类水果摄入有助于预防草酸钙结石形成。