中度肠化通常可以治愈，但需根据具体病因和病情制定个体化治疗方案。肠化生可能与慢性胃炎、幽门螺杆菌感染、长期胆汁反流等因素有关，通过规范治疗多数患者预后良好。
针对幽门螺杆菌感染引起的中度肠化，根除治疗是关键。临床常用四联疗法包括质子泵抑制剂、铋剂及两种抗生素，如奥美拉唑肠溶胶囊、枸橼酸铋钾胶囊、阿莫西林胶囊和克拉霉素片。治疗后可显著改善胃黏膜炎症，部分患者肠化生可能逆转。伴随上腹隐痛或反酸时，可联合铝碳酸镁咀嚼片保护胃黏膜。
由慢性胆汁反流导致的中度肠化需长期管理。患者可能出现腹胀、口苦等症状，建议使用熊去氧胆酸胶囊调节胆汁代谢，配合多潘立酮片促进胃肠蠕动。内镜监测显示肠化生范围较大时，可考虑射频消融术或内镜下黏膜剥离术。术后需定期复查胃镜并检测血清胃蛋白酶原水平。
建议患者保持规律饮食，避免高盐、腌制及辛辣刺激性食物，适当补充维生素C片和硒酵母片。吸烟饮酒会加重黏膜损伤，需严格戒除。每6-12个月进行胃镜及病理复查，动态观察肠化生变化。若发现异型增生等癌前病变，应及时行内镜下治疗。