婴儿急性咽喉炎发作期间通常不建议接种疫苗，症状缓解后可补种。急性咽喉炎可能由病毒或细菌感染引起，常伴随发热、咽痛等症状，需优先治疗原发病。
急性咽喉炎患儿免疫系统处于应激状态，此时接种疫苗可能加重身体负担或影响疫苗效果。部分疫苗含有减毒活病毒成分，在免疫力暂时低下时存在理论上的不良反应风险。咽喉部肿胀可能掩盖疫苗接种后罕见的过敏反应早期表现，增加观察难度。疾病导致的发热可能干扰疫苗反应判断，难以区分是疾病进展还是接种后反应。
少数无症状或症状轻微的咽喉炎患儿，经医生评估后可能允许接种灭活疫苗。对于已预约的强制性疫苗，可待退热24小时后、咽喉红肿消退时补种。部分非活疫苗如乙肝疫苗在病情稳定时经专业评估可能考虑接种，但需严格监测反应。
患儿康复后应及时联系接种单位安排补种，接种前需确认无发热、咽痛等症状持续3天以上。护理期间保持室内空气湿润，使用加湿器缓解咽喉不适，哺乳期母亲应避免辛辣饮食。疫苗接种后需在机构观察30分钟，密切监测体温与进食情况，出现异常哭闹或皮疹应及时就医。