急性根尖周炎进行根管治疗时通常会有轻微疼痛，但多数情况下疼痛可控。根管治疗是清除根管内感染组织的有效方法，治疗过程中医生会使用局部麻醉药物减轻不适感。
根管治疗前医生会注射局部麻醉药物如利多卡因注射液或阿替卡因注射液，能够有效阻断神经传导，使治疗区域暂时失去痛觉。治疗中器械操作可能引起短暂酸胀感，但不会出现剧烈疼痛。部分患者因根尖炎症较重可能出现麻醉效果稍差的情况，医生会通过追加麻醉或调整操作手法缓解。治疗后1-3天可能出现轻微胀痛，属于正常术后反应。
极少数情况下，患者对麻醉药物不敏感或存在复杂解剖变异，可能在治疗中感受到较明显疼痛。这种情况医生会立即停止操作并采取镇痛措施。若根尖脓肿未完全引流或存在器械分离等并发症，也可能导致治疗中疼痛加剧，需要配合超声荡洗或根尖手术等辅助治疗。
根管治疗后应避免用患牙咀嚼硬物，保持口腔清洁，按医嘱服用布洛芬缓释胶囊或对乙酰氨基酚片等镇痛药物。若疼痛持续超过3天或出现肿胀发热，需及时复诊排除感染可能。治疗期间注意休息，避免剧烈运动，饮食以温凉软食为主，有助于减轻术后不适。