肛瘘与肛周脓肿可通过发病阶段、症状表现、检查手段等进行区别。肛周脓肿多为急性感染期表现，肛瘘多为慢性期表现，两者主要有发病机制、临床表现、治疗方法等差异。
肛周脓肿是肛门周围软组织的急性化脓性感染，主要表现为肛门周围红肿热痛，可伴有发热等全身症状，触诊有波动感，血常规检查可见白细胞升高。肛瘘是肛周脓肿破溃或切开引流后形成的慢性管道，表现为肛门周围反复流脓、瘙痒，触诊可触及条索状物，肛门镜检查可见内口，瘘管造影可明确瘘管走行。
肛周脓肿需要及时切开引流，配合抗生素治疗，如头孢克肟分散片、甲硝唑片等。肛瘘通常需要手术治疗，如肛瘘切开术、肛瘘挂线术等，术后需定期换药，保持肛门清洁。两者均可通过肛门指诊、肛门镜、超声等检查辅助诊断，但肛瘘还需行瘘管造影或磁共振检查明确瘘管情况。
日常应注意保持肛门清洁，便后温水坐浴，避免久坐久站，饮食清淡易消化，多摄入膳食纤维预防便秘，出现肛门不适及时就医，避免自行用药延误病情。肛周脓肿患者需遵医嘱足疗程使用抗生素，肛瘘患者术后需定期复查，观察伤口愈合情况，防止复发。