支原体肺炎和普通肺炎的主要区别在于病原体、症状表现、治疗药物及易感人群。支原体肺炎由肺炎支原体引起，普通肺炎则可能由细菌、病毒或真菌等多种病原体导致。
支原体肺炎的病原体为肺炎支原体，属于非典型病原体，主要通过飞沫传播。症状以持续性干咳为主，可能伴随低热、咽痛和乏力，胸片多显示单侧斑片状浸润影。治疗首选大环内酯类抗生素如阿奇霉素片或罗红霉素胶囊，对β-内酰胺类抗生素无效。儿童和青少年为高发人群，病程通常较长但预后良好。
普通肺炎的病原体包括肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等细菌，以及呼吸道合胞病毒等病毒。起病较急，常见高热、脓痰、胸痛，听诊可闻及湿啰音，胸片多呈大叶性实变。治疗需根据病原体选择药物，细菌性肺炎可用阿莫西林克拉维酸钾片或头孢呋辛酯片，病毒性肺炎需抗病毒治疗。老年人和免疫功能低下者易感，重症可能出现呼吸衰竭。
预防两类肺炎均需注意室内通风、佩戴口罩避免飞沫传播，支原体肺炎流行季节减少人群聚集。普通肺炎高危人群可接种肺炎球菌疫苗和流感疫苗。出现持续咳嗽、发热等症状时应尽早就医明确病原体，避免自行使用抗生素。恢复期需保证营养摄入，适量补充维生素C和优质蛋白，避免剧烈运动加重肺部负担。