脑血栓高烧不退可能与感染性并发症、中枢性发热、药物反应、深静脉血栓形成、脱水等因素有关。脑血栓患者出现持续高热需警惕肺部感染、尿路感染等继发问题，或下丘脑体温调节中枢受损导致的中枢性发热。
感染性并发症是脑血栓后高烧的常见原因，卧床患者易发生坠积性肺炎，导尿操作可能引发尿路感染，这些细菌感染会导致体温持续升高，血常规检查可见白细胞计数异常，需通过痰培养、尿培养明确病原体后使用抗生素如头孢曲松钠注射液、左氧氟沙星氯化钠注射液等治疗。中枢性发热多见于脑干或下丘脑部位血栓，因体温调节中枢功能障碍出现39℃以上高热，但患者无汗且四肢冰凉，物理降温效果有限，可能需要使用冰毯等特殊设备，药物可试用溴隐亭片调节体温调定点。
部分抗凝药物如阿替普酶可能引发药物热，通常在用药后7-10天出现弛张热，伴有皮疹或关节痛，需与感染性发热鉴别，必要时更换为那屈肝素钙注射液。下肢深静脉血栓形成后的吸收热通常为低至中度热，若合并肺栓塞可出现骤升型高热，需通过D-二聚体检测和血管超声确诊。重度脱水患者因散热障碍可出现体温升高，尤其伴吞咽困难的脑血栓患者更易发生，通过皮肤弹性测试和血电解质检查可判断，需及时补充复方氯化钠注射液纠正。
脑血栓患者发热期间应每2小时监测体温变化，保持每日2000毫升以上饮水量，采用温水擦浴等物理降温时避免酒精刺激，翻身拍背每2小时一次预防压疮和肺炎，鼻饲饮食者需注意营养配比和管道清洁，恢复期可进行床边被动关节活动预防肌肉萎缩，所有抗生素使用必须严格遵循医嘱完成全程治疗，发现意识改变或体温超过39.5℃需立即通知医护人员处理。