淋巴结穿刺可能引起局部疼痛、出血或血肿、感染、神经损伤等副作用，多数情况下症状轻微且可控。淋巴结穿刺是诊断淋巴结肿大的常用检查手段，需由专业医生操作以降低风险。
局部疼痛是穿刺后最常见的反应，通常表现为穿刺点轻微胀痛，持续1-2天可自行缓解。出血或血肿多与穿刺针损伤小血管有关，按压止血后血肿多在1周内吸收。感染风险较低但需警惕，表现为穿刺部位红肿热痛或发热，需及时抗感染治疗。神经损伤较为罕见，可能因穿刺位置较深导致短暂麻木或肌肉无力，多数可逐渐恢复。
进行淋巴结穿刺后24小时内应避免剧烈运动，保持穿刺部位清洁干燥。观察是否出现持续疼痛、肿胀加重或发热等症状，必要时及时复诊。穿刺后饮食宜清淡，适当补充优质蛋白和维生素C有助于组织修复。避免揉搓或抓挠穿刺部位，洗澡时尽量避开伤口。若需服用抗凝药物应提前告知医生，以评估出血风险。