根除幽门螺杆菌通常需要四联疗法联合使用质子泵抑制剂、铋剂和两种抗生素。根除方案主要有阿莫西林胶囊、克拉霉素片、胶体果胶铋胶囊、奥美拉唑肠溶胶囊等药物组合，治疗周期一般为10-14天。
幽门螺杆菌感染的治疗需严格遵循医生制定的个体化方案。质子泵抑制剂通过抑制胃酸分泌提高抗生素疗效，常用奥美拉唑肠溶胶囊或雷贝拉唑钠肠溶片。铋剂如胶体果胶铋胶囊能在胃黏膜形成保护层，协同杀菌。抗生素组合通常选择阿莫西林胶囊联合克拉霉素片，或甲硝唑片替代克拉霉素片用于耐药病例。治疗期间需避免漏服药物，否则易导致细菌耐药。完成疗程后应间隔4周复查碳13/14呼气试验确认根除效果，期间禁用抑酸药及抗生素影响检测结果。
根除治疗期间需忌烟酒及辛辣刺激食物，减少胃黏膜刺激。日常分餐制避免家庭内传播，餐具定期煮沸消毒。治疗后若出现腹泻或口腔苦味可适量补充益生菌调节肠道菌群，但需与抗生素间隔2小时服用。反复治疗失败者需行胃镜取组织做药敏试验，调整抗生素方案。长期未根除可能诱发胃炎、胃溃疡甚至胃癌风险，建议感染者家庭成员同步筛查。