甲亢治好后通常不会出现后遗症，但少数患者可能因治疗方式或个体差异遗留甲状腺功能减退、突眼加重等问题。甲亢治疗主要包括抗甲状腺药物、放射性碘治疗及手术等方式，不同治疗手段的潜在影响存在差异。
抗甲状腺药物治疗后，多数患者甲状腺功能可恢复正常，但部分人需长期监测甲状腺激素水平。药物可能导致白细胞减少、肝功能异常等副作用，停药后通常可逆。放射性碘治疗后，甲状腺组织被部分破坏，可能引发永久性甲减，需终身服用左甲状腺素钠片替代治疗。突眼症状在甲亢控制后可能持续存在，尤其吸烟者更易进展，需联合糖皮质激素或眼眶减压术干预。
甲状腺全切术后患者必然出现甲减，需规律补充甲状腺激素。手术可能损伤喉返神经导致声音嘶哑，或误切甲状旁腺引发低钙抽搐，但概率较低。既往重症甲亢患者治愈后，偶见心脏扩大或心律失常等遗留问题，需定期心血管评估。
建议治愈后每6-12个月复查甲状腺功能，避免高碘饮食。出现乏力、怕冷、体重骤增等甲减症状时及时就医。突眼患者应戒烟并佩戴墨镜防光刺激，睡眠时抬高床头减轻眶周水肿。规律作息与均衡饮食有助于维持甲状腺功能稳定，避免复发。