附件囊肿通常不能单纯依靠药物完全治愈，但部分功能性囊肿可通过药物辅助消退。附件囊肿的处理方式主要有观察随访、药物治疗、手术治疗等，具体需根据囊肿性质、大小及症状综合判断。
功能性卵巢囊肿如黄体囊肿、滤泡囊肿多与激素波动相关，部分患者服用短效避孕药或孕激素类药物可能促进囊肿吸收。临床常用药物包括屈螺酮炔雌醇片、去氧孕烯炔雌醇片等，这类药物通过抑制排卵和调节激素水平减少囊肿形成。但药物治疗期间需定期复查超声，若囊肿持续存在或增大超过5厘米，需调整方案。
病理性囊肿如子宫内膜异位囊肿、囊腺瘤等通常对药物反应有限。子宫内膜异位囊肿可尝试使用孕三烯酮胶囊、戈舍瑞林缓释植入剂等控制病灶进展，但难以消除已形成的囊肿结构。囊腺瘤等良性肿瘤性囊肿则需手术切除，药物治疗仅作为术前准备或术后辅助。若出现剧烈腹痛、囊肿扭转或破裂等急症，必须立即手术干预。
建议确诊附件囊肿后每3-6个月复查妇科超声，监测囊肿变化。日常避免剧烈运动或腹部受压，出现下腹坠痛、异常阴道出血等症状及时就诊。绝经后女性新发囊肿或囊肿实性成分增多时，应积极排除恶性可能，药物不作为首选治疗方式。