唇腭裂在孕期通常可以通过超声检查发现，但检出率受孕周、胎儿体位及设备分辨率等因素影响。
孕18-24周进行的大排畸超声是筛查唇腭裂的关键时期。此时胎儿面部结构发育较完善，超声可清晰显示上唇连续性及腭部结构。典型唇裂表现为上唇线中断，完全性唇腭裂可能伴随牙槽突裂及鼻翼变形。二维超声对单纯腭裂的检出率较低，三维超声能通过多平面重建提高诊断准确性。若发现异常需进一步进行胎儿磁共振检查确认腭部缺损范围。
少数情况下可能漏诊微小唇裂或不完全性腭裂。孕早期因胎儿面部未充分发育难以识别，孕晚期因胎头入盆或体位遮挡影响观察。某些非典型病例如黏膜下腭裂，超声影像可能仅表现为硬腭骨质不连续而软组织完整。遗传因素如22q11微缺失综合征相关的腭裂可能伴随心脏异常等其它超声软指标。
建议孕妇规范完成产前超声检查，发现异常时配合医生进行遗传咨询。孕期保持均衡营养，避免吸烟饮酒等致畸因素，必要时可考虑羊水穿刺排除染色体异常。出生后需由多学科团队评估喂养、听力及语言发育情况，多数患儿通过序列治疗可获得良好预后。