漱口水不能预防口腔溃疡，但可能有助于缓解症状并减少继发感染风险。口腔溃疡的发生与免疫异常、局部创伤、维生素缺乏等因素相关，漱口水主要通过抗菌作用维持口腔清洁。
部分含抗菌成分的漱口水可减少口腔细菌繁殖，降低溃疡面继发感染概率。聚维酮碘溶液、复方氯己定含漱液等能抑制金黄色葡萄球菌、链球菌等致病菌，缓解溃疡周围红肿。含利多卡因的漱口水可短暂麻痹神经末梢，减轻进食时的疼痛感。但漱口水无法调节免疫或修复黏膜缺损，对溃疡复发无预防作用。
过度使用含酒精的漱口水可能刺激溃疡创面，延缓愈合。频繁使用抗菌漱口水可能破坏口腔菌群平衡，导致真菌感染风险增加。儿童、孕妇等特殊人群应避免含硼砂、水杨酸甲酯等成分的漱口水，可能引起黏膜灼伤或全身吸收毒性。
预防口腔溃疡需综合干预。均衡摄入维生素B族、锌、铁等营养素，避免过硬或过烫食物损伤黏膜。压力管理、规律作息有助于调节免疫功能。反复发作的口腔溃疡可能提示贫血、克罗恩病等系统性疾病，需就医排查病因。发作期可选择无酒精漱口水清洁，配合重组人表皮生长因子凝胶等局部药物促进愈合。