智齿没有拔干净可能导致局部感染、邻牙损伤或囊肿形成。残留的牙体碎片或牙根可能引发牙龈红肿、疼痛、张口受限等症状，严重时可发展为颌骨骨髓炎或神经损伤。
智齿拔除后若存在残留碎片，牙龈组织可能无法完全愈合，形成慢性炎症病灶。食物残渣易滞留于创口周围，滋生细菌导致反复感染，表现为创口持续渗液、异味、颌下淋巴结肿大。部分患者会出现邻牙远中牙根暴露或龋坏，因残留碎片长期压迫导致牙槽骨吸收。临床常见下颌智齿拔除后残留牙根靠近下牙槽神经管，可能诱发持续性下唇麻木或刺痛感。
极少数情况下未清理干净的牙囊组织可能发展为含牙囊肿，压迫下颌骨造成病理性骨折。囊肿继发感染时可形成瘘管，长期不愈可能恶变为成釉细胞瘤。部分患者因残留牙体刺激颞下颌关节区，引发关节弹响、咀嚼肌群痉挛等颞下颌关节紊乱症状。影像学检查可见拔牙窝内高密度影或周围骨密度异常。
建议术后出现持续疼痛、肿胀加重或异常分泌物时及时复诊。保持口腔清洁可使用氯己定含漱液，避免用患侧咀嚼硬物。术后3天出现发热或张口度小于2指需立即就医，可能需二次清创或配合头孢克洛分散片等抗生素治疗。定期口腔检查可早期发现残留牙根导致的骨质异常。