肝素对胎儿的影响通常较小，但需严格遵医嘱使用。肝素主要用于预防和治疗妊娠期血栓性疾病，其分子量较大不易通过胎盘屏障，因此对胎儿发育的直接干扰有限。
肝素在妊娠期使用时需监测凝血功能，避免剂量不足或过量。普通肝素和低分子肝素均属于妊娠期相对安全的抗凝药物，但低分子肝素因半衰期更长、出血风险更低而更常用。使用期间可能出现胎盘早剥、产后出血等并发症，需定期超声检查评估胎儿生长状况。部分孕妇可能出现骨质疏松或血小板减少，需补充钙剂并监测骨密度。
极少数情况下，长期大剂量使用可能影响胎儿骨骼发育，导致新生儿骨质疏松。对于存在遗传性血栓倾向的孕妇，肝素的使用需结合抗凝血酶活性检测调整方案。肝素不会增加胎儿畸形风险，但早产孕妇使用时应评估子宫胎盘血流情况。
妊娠期使用肝素期间应保持均衡饮食，适当增加富含维生素K的深绿色蔬菜。避免剧烈运动防止外伤出血，定期进行胎心监护和凝血功能检查。出现阴道出血、严重牙龈出血或皮肤瘀斑需立即就医。哺乳期使用低分子肝素通常无需中断母乳喂养，但需观察婴儿有无出血倾向。