患有严重心脏病、凝血功能障碍、口腔急性炎症、未控制的糖尿病以及佩戴心脏起搏器的人群不适合洗牙。洗牙可能加重原有疾病或导致感染风险增加。
严重心脏病患者洗牙时可能因紧张或操作刺激诱发心绞痛、心律失常等急性发作。凝血功能障碍者牙龈出血风险显著增高，可能出现难以控制的出血情况。口腔存在急性炎症时洗牙可能造成感染扩散，加重红肿热痛症状。血糖未达标的糖尿病患者术后伤口愈合延迟，感染概率上升。部分洗牙设备产生的电磁场可能干扰心脏起搏器正常工作。
备孕女性、高血压患者、肝炎活动期患者需经专科医生评估后再决定是否洗牙。孕妇前三个月和后三个月应避免洗牙，中期洗牙需提供产科医生许可证明。长期服用抗凝药物者需提前调整用药方案，骨质疏松患者需注意避免过度牙周刺激。头颈部放疗后患者唾液分泌减少，洗牙后需加强口腔保湿护理。
建议有系统性疾病的患者洗牙前进行全面的内科评估，向牙科医师详细说明病史和用药情况。日常应使用软毛牙刷和牙线清洁牙齿，每半年进行一次口腔检查。牙龈出血频繁者可先用生理盐水漱口缓解炎症，待病情稳定后再考虑专业洁治。种植牙患者需选择超声波功率较小的洗牙设备，避免损伤种植体表面。