小腿血栓需根据类型采取抗凝、溶栓或手术治疗。常见处理方式有低分子肝素钙注射液、华法林钠片等药物干预，以及下腔静脉滤器植入术等外科手段。
小腿血栓治疗需区分静脉血栓与动脉血栓。静脉血栓以抗凝为主，常用低分子肝素钙注射液皮下注射过渡至华法林钠片口服，需监测凝血功能。动脉血栓需紧急血管介入取栓，严重者行血管旁路移植术。混合型血栓可联合尿激酶溶栓治疗，但需警惕出血风险。所有患者均需抬高患肢，穿戴医用弹力袜。合并肺栓塞时需行下腔静脉滤器植入术预防血栓脱落。
血栓治疗后需长期随访，避免久坐久站，戒烟限酒，控制血压血糖。饮食宜低盐低脂，适量补充维生素K含量稳定的蔬菜如西蓝花。康复期可进行踝泵运动促进血液循环，每日步行30分钟但避免剧烈运动。出现肢体肿胀加重或胸痛需立即就医。