吲哚美辛栓剂塞肛门使用可能出现副作用，常见包括局部刺激、胃肠反应等，但多数症状较轻微。
吲哚美辛栓剂作为非甾体抗炎药，通过直肠给药可减少对胃肠道的直接刺激，但仍可能引起肛门黏膜灼热感或瘙痒。部分患者用药后可能出现排便次数增多或里急后重感，通常停药后自行缓解。药物经直肠吸收进入全身循环后，可能引发头痛、眩晕等神经系统反应，偶见皮疹等过敏表现。长期大剂量使用需警惕肾功能损害，老年患者更应注意监测。用药期间若出现血便、持续腹痛或视力变化，应立即停用并就医。
极少数情况下可能诱发严重过敏反应，如喉头水肿或支气管痉挛，需紧急医疗干预。心血管疾病患者使用可能增加心力衰竭风险，高血压患者需定期监测血压。与其他非甾体抗炎药联用会加重副作用，活动性消化道溃疡患者禁用。孕妇晚期使用可能导致胎儿动脉导管早闭，哺乳期妇女应权衡利弊。肝功能异常者代谢减慢可能增加毒性，需调整给药间隔。
使用吲哚美辛栓剂时应清洁双手及肛门区域，避免细菌感染。给药后建议卧床休息30分钟以防止栓剂滑出，用药期间保持充足水分摄入。观察排便性状变化，出现黑色柏油样便需警惕消化道出血。饮食宜清淡，避免辛辣刺激食物加重肠道负担。定期复查肝肾功能，长期用药者每3个月检测一次。储存时注意避光防潮，栓剂软化后不可使用。儿童用药须严格遵医嘱，老年患者应从最低有效剂量开始。若需与其他抗凝药合用，必须密切监测出血倾向。