神经官能症可能自愈，但需结合具体类型和严重程度判断。轻度患者通过心理调节、生活方式改善可能逐渐缓解症状，中重度患者通常需要专业干预。
部分神经官能症患者症状较轻，仅表现为短暂的情绪波动或轻微躯体不适，这类情况可能通过自我调节实现症状缓解。建立规律作息、适度运动、减少压力源等行为干预有助于改善自主神经功能紊乱，部分患者症状可随环境适应或应激因素消除而减轻。
若患者存在持续心悸、胃肠功能紊乱或严重焦虑抑郁症状，自愈概率显著降低。这类情况多与神经递质失衡、慢性应激或器质性病变共病相关，需通过认知行为治疗、药物干预等手段控制症状。未经规范治疗的惊恐障碍或躯体形式障碍可能进展为慢性病程，甚至诱发心血管或消化系统器质性疾病。
神经官能症患者应保持均衡饮食，适量增加富含B族维生素的全谷物、深绿色蔬菜及深海鱼类摄入，避免酒精和咖啡因刺激。建议每周进行3-5次有氧运动如快走或游泳，配合腹式呼吸训练调节自主神经功能。症状持续两周以上或影响日常生活时，需及时至精神心理科或神经内科就诊，通过心率变异性检测、心理评估等明确病因，必要时遵医嘱使用选择性5-羟色胺再摄取抑制剂或短期苯二氮卓类药物，治疗期间定期复诊评估疗效并调整方案。