月经干净后两三天同房通常怀孕概率较低，但并非绝对不可能。怀孕概率与女性排卵时间、月经周期规律性等因素密切相关。
月经周期规律的女性，排卵日通常在下次月经前14天左右。卵子排出后在输卵管内可存活1-2天，精子在女性生殖道内可存活2-3天。月经干净后两三天处于卵泡期，此时卵泡尚未成熟，若无提前排卵的情况，同房后精卵结合的概率较小。但部分女性月经周期较短或排卵时间提前，可能在月经结束不久后即进入排卵期，此时同房存在受孕可能。
月经周期不规律的女性排卵时间难以预测，可能出现意外排卵。部分女性在月经刚结束时就已接近排卵期，此时同房受孕风险相对增高。女性排卵可能受情绪波动、环境变化、药物等因素影响而提前或延后，即使在安全期同房也存在意外怀孕的可能性。
若无生育计划，建议采取可靠的避孕措施。安全期避孕法失败率较高，可选择避孕套、短效避孕药等更有效的避孕方式。若出现月经延迟、恶心呕吐等早孕症状，建议及时进行早孕检测或就医检查。日常应注意记录月经周期，了解自身排卵规律，有助于更好地进行生育规划。