杞菊地黄丸和明目地黄丸的主要区别在于成分侧重与功效适应症不同。杞菊地黄丸含枸杞子、菊花等，侧重滋肾养肝明目；明目地黄丸含石决明、蒺藜等，侧重平肝潜阳、清肝明目。两者均可用于肝肾阴虚引起的视物模糊，但具体应用需结合证型。
杞菊地黄丸以六味地黄丸为基础方，添加枸杞子、菊花两味药材。枸杞子滋补肝肾、益精明目，菊花散风清热、平肝明目，二者协同增强养肝明目功效。该药适用于肝肾阴虚兼有虚火上炎证候，如视物昏花、眼干涩伴头晕耳鸣、咽干口燥等。现代常用于早期老年性白内障、视疲劳、干眼症等。服药期间忌辛辣油腻，感冒发热不宜使用。
明目地黄丸在六味地黄丸基础上配伍石决明、蒺藜、当归等。石决明平肝潜阳、清肝明目，蒺藜祛风明目，当归养血活血，整体侧重清肝火、散风邪。适用于肝阳上亢或肝经风热证候，如目赤肿痛、畏光流泪伴头痛眩晕、烦躁易怒等。现代多用于结膜炎、青光眼早期辅助治疗。脾胃虚寒者慎用，服药期间避免情绪激动。
从药物组成看，杞菊地黄丸更突出滋补肝肾之阴，适合虚证；明目地黄丸侧重清肝平肝，适合虚实夹杂证。从现代应用看，前者多用于退行性眼病，后者多用于炎症性眼病。两者均含熟地黄、山茱萸等滋肾成分，但配伍差异形成功效偏重。具体用药需经中医辨证，不可自行替换使用。
使用地黄丸类中成药期间，均需注意规律作息，避免熬夜伤阴。饮食宜清淡，多食深色蔬菜如菠菜、胡萝卜补充维生素A。避免长时间用眼，每用眼1小时应远眺或闭目休息5分钟。若服药2周症状未缓解，或出现眼痛加剧、视力骤降等情况，应立即停用并就医检查。糖尿病患者服用含蜂蜜丸剂时需监测血糖变化。