甲状腺恶性肿瘤切除后存在复发可能，但概率相对较低。复发风险与肿瘤类型、分期、手术彻底性及术后管理等因素相关。
甲状腺乳头状癌和滤泡状癌属于分化型甲状腺癌，术后复发概率通常不足百分之十。这类肿瘤生长缓慢，若手术完整切除病灶且无淋巴结转移，配合规范的术后碘131治疗和甲状腺激素抑制疗法，可显著降低复发风险。髓样癌和未分化癌恶性程度较高，尤其未分化癌即使切除也可能在数月内复发。手术中若残留微小病灶或存在远处转移，复发风险会明显上升。术后定期监测甲状腺功能、甲状腺球蛋白水平及颈部超声检查有助于早期发现复发迹象。
极少数情况下，即使病理显示切缘阴性且完成辅助治疗，仍可能出现局部复发或远处转移。这种情况多见于肿瘤多灶性生长、包膜侵犯或血管浸润患者。部分遗传性髓样癌患者因RET基因突变，可能对侧腺体再次发生癌变。术后五年内为复发高峰期，但分化型癌也可能在十年后迟发复发，需终身随访。
术后应严格遵医嘱进行甲状腺激素替代治疗，维持TSH在目标范围。避免颈部过度辐射暴露，均衡摄入硒、锌等微量元素。每6-12个月复查颈部超声，发现可疑结节及时穿刺活检。保持规律作息和适度运动，有助于调节免疫功能降低复发风险。