松果体生殖细胞瘤通常可以治愈的，治愈概率与肿瘤分期、病理类型及治疗方式密切相关。早期局限性肿瘤通过手术联合放化疗可实现长期无病生存，晚期或复发患者需个体化综合治疗。
松果体生殖细胞瘤对放疗高度敏感，单纯放疗对纯生殖细胞瘤的5年生存率可达较高水平。局限期患者采用全脑全脊髓照射联合局部加量，配合以顺铂为基础的化疗方案，可显著降低复发风险。手术在获取病理诊断和解除脑积水方面具有关键作用，尤其适用于混合性生殖细胞瘤或放疗后残留病灶。儿童患者需采用剂量调整方案以减少生长迟缓等远期副作用。
难治性病例可能涉及畸胎瘤成分或肿瘤标志物异常升高，需强化疗联合自体干细胞移植。治疗期间需密切监测β-HCG和AFP等肿瘤标志物，影像学随访应持续至少5年。部分患者可能出现内分泌功能障碍，需长期补充甲状腺激素或生长激素。多学科协作模式可优化治疗方案选择，质子治疗等新技术有助于减少正常组织损伤。
确诊后应尽快开始规范化的综合治疗，避免自行中断疗程。治疗期间保持充足蛋白质摄入，适度进行康复训练。定期复查垂体功能和视野检查，出现头痛呕吐等颅高压症状需及时就医。避免剧烈运动防止肿瘤出血，心理疏导有助于改善治疗依从性。