百色市第二人民医院始建于1978年，是百色市唯一一所集精神医疗、科研及教学于一体的国家二级精神疾病专科医院，是全市精神卫生防治技术指导与培训机构，全市城镇职工医保、新型农村合作医疗、低保医疗救助定点医院。2014年3月，市编委会正式下文同意百色市精神卫生中心挂靠医院，实行两块牌子一套人员管理。2016年11月11日，经自治区司法厅组织专家评审，医院取得司法鉴定机构许可证及鉴定人执业证，成立了百色市精神卫生中心司法鉴定所，填补了百色市法医精神病鉴定、精神障碍医学鉴定的空白。医院定编病床350张，实际开放病床350张。核定人员编制数140人，现在职在编人员为123人，聘用人员121人，离退休人员64人。在职人员中卫生专业技术人员187人（副高以上职称26人，中级职称45人），管理人员6人。医院分为总院和城北综合门诊部两部分，总院位于东坪路长蛇岭巷29号，城北综合门诊部位于城北二路36号。总院主要为办公和开展精神专科疾病诊疗业务，设有党政办、医务科、护理部、人事科、财务科、感控科、质控科、精神卫生防治管理工作办公室、保卫科、总务科、信息科等11个职能科室，设有精神一科、精神二科、精神三科、精神四科等4个临床科室，设有检验科、医技科、药剂科3个辅助科室。城北综合门诊部主要开展颈腰腿痛、癫痫、心理障碍疏导与治疗等业务，设有内一科、内二科、心理科3个临床科室。近年来，医院秉承“大专科、小综合”的发展理念，在不断强化发展精神科“大专科”的同时，积极培植和发展“小针刀疗法”、“传统中医药疗法治疗内科疾病”等特色诊疗业务。精神科主要诊治各种类型的精神病、慢性酒精中毒、抑郁症、焦虑症等疾病，诊疗技术和规模在西南周边地区处于领先水平。医院城北综合门诊部内科开展的“小针刀”特色疗法、“药刀靶向”疗法治疗颈椎病、腰椎病、脑血管疾病后遗症、各型关节疼痛疾病和“传统中医药疗法”治疗常见神经内科疾病等，技术先进、疗效显著，深受患者的好评；心理科是百色市率先开展心理咨询与心理治疗的临床科室，具有完善的心理测定系统，可以针对不同人人群进行心理咨询、检查、治疗。医院组建的心理危机干预救援团队拥有心理治疗师1人、二级心理咨询师2人、三级心理咨询师7人。医院拥有CT、进口全自动生化分析仪、脑电地形图仪、光化学免疫分析仪、CR、B超、X光机等一批检验检查设备。

医院占地面积3.8万平方米，建筑面积2.8万平方米，院内绿树成荫，花团锦簇、环境怡人，医院先后获得了“百色市园林绿化先进单位”、“百色市爱国卫生先进单位”、“右江区文明单位”等荣誉称号。