潜伏期:疱疹性咽峡炎感染后一般不会马上发病，这个时期称之为潜伏期，一般为1-2天左右，虽然潜伏期的疱疹性咽峡炎患者不会有任何症状，但体内病毒大量复制，具有一定的传染性。前驱期:疱疹性咽峡炎的潜伏期过后，便是前驱期，这个时期患儿有发热的症状，高烧温度可达到38-40℃，同时可能伴有咽红、食欲不好等症状。这个时期大概为1天。水疱期:当病情继续发展，患儿开始进入水疱期，这个时期的患者除了表现出高烧症状外，患儿的上颚粘膜会出现红色水疱。这个时期一般持续2-3天。溃疡期:当口腔内水疱继续发展2-3天后，患者会出现低烧或者烧退的现象，但水疱开始破溃，口腔出现溃疡面，患儿开始感到口腔疼痛，出现流口水、拒食等症状。