亚麻籽油可以直接口服或凉拌食用，也可低温烹饪使用。
亚麻籽油富含α-亚麻酸等不饱和脂肪酸，建议每日食用10-15毫升。直接口服时可搭配温水吞服，有助于营养吸收。凉拌时可将亚麻籽油与蔬菜、水果等食材混合，避免高温破坏营养成分。低温烹饪指油温不超过120摄氏度，适合蒸煮、炖汤等烹调方式。亚麻籽油不宜高温煎炸，否则会产生有害物质。开封后需冷藏保存并在两个月内用完，避免氧化变质。对亚麻籽过敏者应禁用，胃肠功能较弱者初次食用需减量。
日常可将亚麻籽油加入酸奶、麦片等食物中，注意控制总摄入量并保持饮食均衡。