深色鸡蛋和浅色鸡蛋的营养价值通常没有显著差异，鸡蛋颜色主要由母鸡品种决定，与营养成分无关。鸡蛋的主要营养包括优质蛋白、卵磷脂、维生素A、B族维生素、铁等，这些成分在深色和浅色鸡蛋中含量相近。
鸡蛋壳颜色由母鸡体内原卟啉色素沉积程度决定，与鸡蛋内部营养无关。深色蛋壳多见于某些特定品种的鸡，如罗岛红鸡或马兰白鸡，而白壳蛋则多由白来航鸡生产。无论蛋壳颜色如何，鸡蛋内部的蛋白质含量约为每100克含13克，脂肪含量约11克，且均含有全部必需氨基酸。蛋黄中的叶黄素和玉米黄素含量可能因饲料不同略有波动，但蛋壳颜色并非判断依据。烹饪方式对营养保留的影响远大于蛋壳颜色差异，水煮或蒸蛋能最大限度保留营养素。
选择鸡蛋时更应关注新鲜度与储存条件。新鲜鸡蛋的蛋黄呈凸起半球形，蛋白浓稠分层明显。储存时应置于冰箱冷藏室，避免与气味强烈的食物接触。对鸡蛋过敏者、高胆固醇血症患者需控制摄入量，普通成年人每日1-2个鸡蛋即可满足营养需求。散养鸡蛋可能含有稍高的ω-3脂肪酸，但这与蛋壳颜色无必然关联。
