丘脑下部损害的原因可能有：
感染性疾患 。如病毒性脑炎、流行性脑炎等。
肿瘤 。如嫌色细胞瘤、嗜酸或嗜碱细胞瘤等。
肉芽肿性损害 。如网状内皮细胞增生症、结节病等。
先天性或遗传因素 。如kallmann综合征等。
退行性病变 。如结节性硬化、脑硬化等。
血管损害 。如脑动脉硬化、脑动脉瘤等。
物理性因素 。如脑外伤等。
脑代谢病 。如CO2麻醉等。
药物影响 。如氯丙嗪、利血平等。
功能性障碍 。因环境变化、精神创伤引起。
暴力作用方向直接或间接经过丘脑下部者，皆可能导致局部损伤；小脑幕切迹下疝时亦可累及此区域。
