黄疸42天不退可能影响智力发育，但需结合具体病因判断。新生儿黄疸分为生理性和病理性，若为胆红素脑病等严重病因未及时干预，可能造成神经系统损伤。
生理性黄疸通常在出生后2周内消退，早产儿可能延迟至3周。若42天仍未消退，需考虑母乳性黄疸、感染、胆道闭锁等病理性因素。母乳性黄疸与母乳中某些成分抑制胆红素代谢有关，表现为皮肤黄染持久但程度较轻，婴儿一般状态良好，很少引起智力损害。感染因素如新生儿败血症、尿路感染等可导致胆红素代谢异常，伴随发热、吃奶差等症状，及时抗感染治疗可避免并发症。胆道闭锁属于危急情况，胆汁淤积会导致进行性肝损伤，除黄疸外常有陶土色大便和肝脾肿大，需在60天内手术干预以防智力受损。
当血清胆红素超过342μmol/L时可能透过血脑屏障，沉积于基底神经节引发胆红素脑病。急性期表现为嗜睡、肌张力减低及吸吮反射消失，慢性期遗留手足徐动、高频耳聋等神经系统后遗症。早产儿、低体重儿及合并酸中毒、低蛋白血症者更易发生脑损伤。头颅核磁共振可见苍白球对称性异常信号，脑干听觉诱发电位检查有助于早期发现听神经损害。
建议家长每日监测黄疸变化范围，观察婴儿精神状态与吃奶情况。若发现黄疸蔓延至手足心、伴随嗜睡或尖叫等症状，须立即就医检测血清胆红素水平。蓝光照射仍是安全有效的退黄方法，严重病例需换血治疗。哺乳母亲可暂停母乳3天鉴别是否为母乳性黄疸，期间定期挤奶维持泌乳。注意保持婴儿皮肤清洁，避免抓破黄疸部位引发感染，适当晒太阳时需保护眼睛与会阴部。