胃酸分泌过多者、低血压患者、肾结石高风险人群、过敏体质者及服用特定药物者不适合喝西芹汁。西芹汁含有较多草酸和呋喃香豆素类物质，可能加重原有疾病或引发不良反应。
胃酸分泌过多者饮用西芹汁可能刺激胃黏膜，导致反酸、烧心等症状加重。西芹汁的pH值较低，空腹饮用时更容易引发胃肠不适。低血压患者需谨慎，西芹中的芹菜素具有轻微降压作用，可能加剧头晕、乏力等低血压症状。肾结石高风险人群应避免大量摄入，西芹汁中草酸含量较高，可能增加草酸钙结石形成概率。过敏体质者可能出现口腔过敏综合征，表现为嘴唇肿胀、喉咙发痒等速发型过敏反应。服用华法林等抗凝药物者需注意，西芹汁的维生素K含量可能干扰药物抗凝效果。
特殊情况下，孕妇饮用西芹汁需控制量，过量可能刺激子宫收缩。术后恢复期患者应避免饮用，西芹汁可能影响伤口愈合过程。存在电解质紊乱者不宜大量饮用，西芹汁的利尿作用可能加重电解质失衡。甲状腺功能异常者需咨询医生，西芹汁中的硫氰酸盐可能干扰碘吸收。正在接受化疗的患者应避免饮用，西芹汁中的光敏物质可能增加皮肤对辐射的敏感性。
健康人群饮用西芹汁建议控制在200毫升以内，避免空腹饮用以减少胃肠刺激。榨汁前应将西芹充分清洗去除农药残留，饮用后出现皮疹、腹泻等不适需立即停用。合并慢性疾病者饮用前应咨询营养师或医生，根据个体情况调整饮食方案。日常饮食中可搭配黄瓜、胡萝卜等低草酸蔬菜平衡营养摄入，同时保持充足饮水促进代谢。储存西芹汁应使用密封容器冷藏，存放时间不超过12小时以保证食品安全。