健脾丸在常规剂量下副作用较少，但部分人群可能出现胃肠不适、过敏反应等不良反应。健脾丸主要由党参、白术、陈皮等中药组成，具有健脾益气、和胃消食的功效，适用于脾胃虚弱引起的食欲不振、腹胀等症状。
健脾丸的不良反应多与个体体质或用药不当有关。部分患者服药后可能出现轻度恶心、腹胀加重等胃肠反应，通常与空腹服用或脾胃功能过弱有关。少数患者对药物成分过敏时可能出现皮肤瘙痒、红疹等过敏表现，需立即停药。长期过量服用可能干扰胃肠正常功能，导致依赖性消化不良。药方中的陈皮等成分可能刺激胃酸分泌，胃溃疡患者需谨慎使用。儿童、孕妇及哺乳期妇女应在医师指导下用药，避免自行调整剂量。
服用健脾丸期间需注意饮食清淡，避免辛辣油腻食物加重脾胃负担。出现持续腹泻、呕吐或过敏症状时应及时就医。不建议与含有人参、五灵脂等成分的中成药同服，以免药效冲突。脾胃虚弱者平时可适当食用山药、红枣等健脾食材，配合腹部按摩促进消化功能恢复。用药超过两周症状未改善需复诊调整治疗方案。