小茴香适量食用通常不会对身体产生明显副作用，但过量或特殊体质可能引发胃肠不适、过敏反应等问题。小茴香是常见的调味料和中药材，具有温中散寒、理气止痛等功效，合理使用安全性较高。
小茴香含有挥发油、茴香脑等活性成分，正常烹饪用量对多数人无不良影响。其膳食纤维有助于促进胃肠蠕动，但过量摄入可能刺激胃肠黏膜，导致腹胀、腹泻等不适。部分人群可能因体质敏感出现轻微烧心或反酸，通常减少摄入量即可缓解。小茴香中的光敏性成分在极少数情况下可能增加皮肤对紫外线的敏感性，日常食用剂量下该风险极低。
过敏体质者接触小茴香可能出现皮肤瘙痒、皮疹或呼吸道症状，此类情况需立即停止食用并就医。长期大量服用小茴香提取物可能干扰凝血功能，手术前两周应避免高剂量摄入。孕妇及哺乳期妇女建议控制食用量，避免使用浓缩制剂。小茴香与抗凝血药物合用时需谨慎，可能增强药物效果。
日常使用小茴香建议优先选择烹饪调味方式，每日摄入量不超过5克干品为宜。出现不良反应后应暂停食用，饮用温水帮助代谢。储存时需保持干燥避光，避免霉变产生毒素。若需药用应咨询中医师，根据体质辨证使用。特殊健康状况者建议在医生指导下控制摄入频率和剂量。