通宣理肺丸与养阴清肺丸的主要区别在于适应证和药物成分，前者适用于风寒咳嗽，后者适用于肺阴虚燥咳。
通宣理肺丸由紫苏叶、前胡、桔梗等组成，具有解表散寒、宣肺止咳的功效，主要用于风寒束表、肺气不宣引起的咳嗽痰白、鼻塞流清涕等症状。其药性偏温，适合外感风寒初期使用。养阴清肺丸则含地黄、麦冬、玄参等滋阴药材，功能为养阴润燥、清肺利咽，针对肺阴不足导致的干咳少痰、咽喉干痛、声音嘶哑等症，药性偏凉润，适合阴虚体质或久咳伤阴者。两者成分无重叠，且一温一凉，不可互相替代。
从禁忌证看，通宣理肺丸不适用于风热或痰热咳嗽，服用期间忌食辛辣油腻；养阴清肺丸则不宜用于风寒或痰湿咳嗽，脾胃虚寒者慎用。从现代应用看，通宣理肺丸多用于感冒初期或急性支气管炎，养阴清肺丸更常用于慢性咽炎、支气管炎恢复期。
使用两类药物前需准确辨证，风寒咳嗽误用养阴药可能加重症状，肺阴虚咳误用宣散药易耗伤津液。咳嗽超过一周无缓解或伴有发热、咯血等症状时应及时就医。日常需注意保暖防寒，风寒咳嗽者可饮用姜枣茶辅助散寒，肺阴虚者宜食银耳、百合等滋阴之品，避免辛辣刺激食物。咳嗽期间保持室内空气湿润，戒烟限酒，适度锻炼增强肺卫功能。