蜂蜜不宜与葱、韭菜、豆腐、豆浆、生冷海鲜等同食，可能引起消化不良或影响营养吸收。特殊人群需注意蜂蜜与部分药物的相互作用。
蜂蜜与葱类食物同食可能刺激胃肠黏膜，导致腹痛或腹泻。葱含有硫化物，与蜂蜜中的有机酸结合可能产生轻微毒性反应，胃肠功能较弱者应避免。
韭菜富含草酸，与蜂蜜同食易形成草酸钙沉淀，长期可能增加结石风险。豆腐和豆浆中的蛋白质与蜂蜜单糖结合会降低蛋白质吸收率，影响营养价值。
生冷海鲜与蜂蜜同食可能加重胃肠负担，海鲜中的异性蛋白与蜂蜜反应可能引发过敏。糖尿病患者服用降糖药期间食用蜂蜜需监测血糖，可能增强药物作用导致低血糖。
蜂蜜与部分中药如麻黄、桂枝同服可能影响药效，服用中药前应咨询医师。一岁以下婴儿禁止食用蜂蜜，可能因肉毒杆菌污染导致中毒。
高温烹煮蜂蜜会破坏活性酶成分，建议60摄氏度以下温水冲泡。金属容器储存蜂蜜易产生化学反应，建议使用玻璃或陶瓷器皿密封保存。
日常食用蜂蜜建议避开上述禁忌食物，成人每日摄入量控制在25-50克为宜。晨起空腹饮用蜂蜜水可促进排便，但胃酸过多者应餐后服用。储存时应置于阴凉干燥处，结晶属于正常物理现象不影响品质。特殊体质或慢性病患者食用前应咨询营养师，出现腹胀、皮疹等不适需立即停用。合理搭配蜂蜜与温性食物如牛奶、燕麦可增强营养价值，避免与寒凉食物同食加重体寒症状。