绿豆煲莲藕汤不适合脾胃虚寒、腹泻便溏、经期女性、低血压人群及肾病患者饮用。绿豆性寒，莲藕偏凉，可能加重原有症状或诱发不适。
绿豆性寒凉，具有清热解毒功效，但过量食用易损伤脾胃阳气。脾胃虚寒者饮用后可能出现腹胀、腹痛、食欲减退等症状，长期饮用可能加重消化不良。莲藕富含膳食纤维，腹泻便溏者食用可能刺激肠道蠕动，导致腹泻加重。经期女性体质偏虚，寒凉食物可能引起经血淤滞或痛经，绿豆中的植物蛋白还会影响铁吸收。
低血压人群饮用绿豆汤可能因钾离子过量导致血压进一步降低，出现头晕乏力。肾病患者需限制植物蛋白摄入，绿豆中嘌呤和钾含量较高，可能增加肾脏代谢负担。术后恢复期患者也应慎用，寒凉特性可能影响伤口愈合速度。对豆类过敏者需绝对避免，可能引发皮肤瘙痒或呼吸道水肿等过敏反应。
健康人群饮用绿豆煲莲藕汤时建议搭配生姜、红枣等温性食材中和寒性，每周饮用不超过3次，单次用量控制在200毫升以内。饮用后若出现胃肠不适可热敷腹部，饮用红糖姜水缓解。特殊体质者应先咨询中医师，根据体质调整食材配伍，如添加山药、芡实等健脾食材。储存时须冷藏并24小时内饮用完毕，避免微生物污染导致腹泻。