百令胶囊的主要功效为补肺肾、益精气，适用于肺肾两虚引起的咳嗽、气喘、腰背酸痛等症状，也可用于慢性支气管炎的辅助治疗。
1、补肺肾
百令胶囊所含发酵冬虫夏草菌粉具有滋肺阴、补肾阳的作用，能改善肺肾两虚导致的久咳虚喘、气短乏力。对于慢性阻塞性肺疾病患者，可减轻活动后呼吸困难症状。
2、调节免疫
该药可通过激活巨噬细胞功能增强机体免疫力，对反复呼吸道感染、术后免疫力低下者有辅助治疗作用，但不可替代免疫调节药物。
3、改善肾功能
对早期糖尿病肾病、慢性肾炎患者，可辅助降低尿微量白蛋白，延缓肾功能恶化进程，需配合控制血糖、血压等基础治疗。
4、缓解疲劳
适用于肿瘤放化疗后或慢性消耗性疾病导致的精气不足，能改善倦怠乏力、食欲减退等虚弱状态，但需排除器质性疾病。
5、辅助降压
对高血压伴肾虚证候者，与降压药联用可能有助于稳定血压，尤其适用于更年期女性出现的阴虚阳亢型高血压。
使用百令胶囊期间应忌食辛辣刺激食物，避免与藜芦、五灵脂等中药同服。慢性病患者需定期复查相关指标，不可自行增减剂量。服药2周后症状无改善或出现咽痛、皮疹等不良反应时应停药就医。儿童、孕妇及过敏体质者须在医师指导下使用，感冒发热期间暂停服用。