根管治疗后牙齿轻微疼痛可能由治疗刺激、暂时性炎症或咬合问题引起，通常1-3天可缓解。若疼痛持续超过1周或伴随肿胀、脓液，需考虑继发感染或治疗不完善。
根管治疗过程中器械对根尖周组织的机械刺激可能导致术后短暂疼痛，这种疼痛多为钝痛，咀嚼时加重，一般24-48小时逐渐消退。使用氢氧化钙糊剂等充填材料时，部分患者可能出现材料溢出根尖孔引发的化学性刺激反应，表现为遇冷热敏感，通常3-5天自行消失。治疗后的牙齿因失去牙髓营养供给变得脆弱，若未及时安装牙冠保护，咀嚼硬物可能导致牙体隐裂，产生定点咬合痛，这种疼痛呈尖锐性且持续时间较长。根管预备不彻底残留坏死牙髓组织时，厌氧菌繁殖会引发根尖周炎，疼痛呈持续性跳痛，叩诊阳性，X线片显示根尖阴影。少数情况下侧支根管遗漏或根管壁穿孔会导致长期隐痛，伴牙龈窦道形成，需锥形束CT确诊。
根管治疗后应避免患侧咀嚼过硬食物，使用含氯己定的漱口水维护口腔卫生。出现持续疼痛时可局部冷敷，布洛芬缓释胶囊可短期缓解症状，但禁止长期自行服用止痛药。治疗后1周内出现剧烈疼痛、面部肿胀或发热症状时，需立即复诊排除急性根尖脓肿。建议治疗后3个月复查X线评估根尖愈合情况，6个月内完成全冠修复防止牙折。日常可使用含氟牙膏配合软毛牙刷清洁，定期洁牙预防邻牙龋坏。