隐性梅毒需通过规范药物治疗才能转阴，主要采用青霉素类抗生素如苄星青霉素注射液、普鲁卡因青霉素注射液等，配合定期血清学检测。梅毒螺旋体感染后若未及时治疗可能引发神经梅毒、心血管梅毒等严重并发症。
隐性梅毒的治疗核心是足量、足疗程使用青霉素。苄星青霉素注射液需每周肌肉注射一次，连续3周，可有效杀灭血液中的梅毒螺旋体。普鲁卡因青霉素注射液需每日肌肉注射，连续10-14天，适用于对苄星青霉素过敏者。治疗期间可能出现吉海反应，表现为发热、头痛等，需提前告知医生。完成治疗后每3个月需复查非特异性抗体滴度，连续2次检测结果呈阴性且无临床症状可判定治愈。若对青霉素过敏，可选用多西环素片或红霉素肠溶片替代，但疗效相对较差。
隐性梅毒患者在治疗期间应避免性接触直至确认治愈，伴侣需同步接受检测和治疗。保持规律作息，避免熬夜、饮酒等降低免疫力的行为。饮食上增加优质蛋白和维生素摄入，如鸡蛋、瘦肉、西蓝花等，有助于提升药物疗效。治疗后需严格遵医嘱完成5年随访，第一年每3个月复查血清学指标，之后每年复查1次，防止复发或再感染。日常注意会阴清洁，使用专用毛巾浴具，避免与他人共用剃须刀等可能接触血液的物品。