激光打标机可能对眼睛造成暂时性或永久性损伤，具体影响与激光波长、功率及暴露时间有关。主要风险包括角膜灼伤、视网膜损伤、晶状体混浊等。
激光打标机工作时发射的可见光或近红外激光可能直接损伤角膜上皮细胞，导致疼痛性角膜上皮脱落，表现为畏光、流泪及视物模糊。若激光穿透角膜到达视网膜，高能量光束会灼伤黄斑区感光细胞，造成中心视力下降或视野缺损，这种损伤通常不可逆。部分紫外波段激光还可能引发晶状体蛋白质变性，长期暴露可能加速白内障形成。操作时激光散射或反射光也可能通过间接照射损伤眼睛，尤其当环境中存在镜面反射材料时风险更高。工业级激光打标机的瞬时功率超过人眼安全阈值，即使短暂直视也可能造成严重损害。
操作激光打标机时应全程佩戴符合ANSI Z136标准的防护眼镜，镜片需针对特定激光波长进行光学密度认证。工作区域需设置激光安全警示标识，避免非操作人员进入。设备需配备互锁装置确保激光发射时防护罩处于闭合状态。定期检查光学元件是否偏移或污染，反射镜表面灰尘可能增加散射风险。若发生激光意外照射眼睛，应立即闭眼并转动眼球减少能量聚焦，用清洁生理盐水冲洗后尽快就医进行眼底检查。日常可补充富含叶黄素、玉米黄质的深色蔬菜帮助视网膜抗氧化防护。