复方鱼腥草合剂具有清热解毒、消肿止痛的功效，主要用于治疗风热感冒、咽喉肿痛等上呼吸道感染症状。
1、清热解毒
复方鱼腥草合剂中的鱼腥草、黄芩等成分能抑制多种病原微生物，帮助清除体内热毒，缓解发热、头痛等风热症状。对上呼吸道感染初期出现的咽干、咳嗽有较好效果。
2、抗炎消肿
该药含有的连翘、板蓝根等成分可减轻咽喉黏膜充血水肿，改善吞咽疼痛。对急性扁桃体炎、急性咽炎导致的咽喉异物感有明显缓解作用。
3、止咳化痰
药物中的桔梗、苦杏仁能稀释呼吸道分泌物，促进痰液排出。适用于感冒伴随的干咳或痰黏难咯症状，但痰多清稀者慎用。
4、免疫调节
鱼腥草多糖等活性成分可增强巨噬细胞吞噬能力，提高机体抗病毒能力。在流感季节提前服用可降低感染概率。
5、抗菌抗病毒
体外实验表明其对金黄色葡萄球菌、流感病毒等有抑制作用，可辅助控制继发细菌感染。但严重感染仍需联合抗生素治疗。
使用复方鱼腥草合剂期间应避免辛辣刺激饮食，多饮温水保持咽喉湿润。服药3天后症状无缓解或出现皮疹、呼吸困难等过敏反应时应停药就医。风寒感冒者及孕妇慎用，儿童用量需遵医嘱调整。储存时需密封避光，性状发生改变时禁止服用。