墨旱莲具有凉血止血、滋补肝肾、清热解毒的功效，主要用于治疗吐血、衄血、崩漏、肝肾阴虚、须发早白等病症。
1、凉血止血
墨旱莲性寒味甘酸，归肝、肾经，能清血分热邪而止血。对血热妄行引起的吐血、衄血、便血、崩漏下血等症状有显著疗效，常与生地黄、侧柏叶等配伍使用。其止血作用主要通过缩短凝血时间、增强毛细血管抵抗力实现。
2、滋补肝肾
墨旱莲含有黄酮类、多糖等活性成分，可补益肝肾精血。适用于肝肾阴虚导致的头晕目眩、腰膝酸软、须发早白等症状，常与女贞子配伍组成二至丸。现代研究表明其具有抗氧化、延缓衰老作用。
3、清热解毒
墨旱莲对热毒疮疡、湿疹瘙痒等皮肤病症有解毒消肿之效，可外用鲜品捣敷或煎汤熏洗。其乙醇提取物对金黄色葡萄球菌等致病菌有抑制作用，这与其含有的蟛蜞菊内酯等成分有关。
4、调节免疫
墨旱莲多糖能促进淋巴细胞增殖，增强巨噬细胞吞噬能力，提高机体免疫力。临床可用于辅助治疗因免疫功能低下引发的反复感染，但需配伍黄芪等补气药物协同增效。
5、护肝降酶
墨旱莲中的香豆素类成分对四氯化碳所致肝损伤有保护作用，能降低血清转氨酶水平。在肝炎辅助治疗中常与五味子、垂盆草等同用，但肝功能严重损害者须配合专业医疗方案。
使用墨旱莲时需注意脾胃虚寒者慎用，长期服用建议定期监测肝肾功能。鲜品外用可能出现接触性皮炎，过敏体质者应先做皮肤测试。日常可配伍枸杞、菊花代茶饮用于养生保健，但治疗疾病时应在中医师指导下辨证组方，避免自行大剂量使用。储存时应置阴凉干燥处，防止霉变影响药效。