肛瘘手术后通常会出现疼痛，疼痛程度因人而异，与手术方式、个人耐受度等因素有关。
肛瘘手术后的疼痛主要来源于手术创面的刺激和局部炎症反应。术后1-3天疼痛较为明显，尤其在排便时可能加重，这与肛门括约肌收缩、粪便摩擦创面有关。医生会根据情况开具止痛药物如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等缓解症状。术后7-10天疼痛逐渐减轻，但若出现持续剧烈疼痛或伴随发热、脓性分泌物增多，需警惕感染或创面愈合不良。
少数患者可能因个体差异、创面较大或术后护理不当出现较长时间的隐痛，通常与瘢痕形成或局部神经敏感有关。这类情况可通过温水坐浴、红外线理疗等物理方法改善，必要时需复查排除复发可能。
术后建议保持肛门清洁，每次排便后用温水冲洗；饮食选择高纤维食物如燕麦、西蓝花预防便秘；避免久坐久站，可侧卧减轻创面压力。术后2周内禁止剧烈运动，遵医嘱定期换药复查。若疼痛持续不缓解或出现异常分泌物，应及时就医处理。