肛旁脓肿切开手术后可能形成肛瘘，但并非必然发生。肛瘘的形成与术后感染控制、创面愈合情况以及个体体质等因素有关。
肛旁脓肿切开手术后，若脓腔引流彻底且术后护理得当，创面可逐渐愈合而不形成肛瘘。术后需保持局部清洁，遵医嘱使用抗生素如头孢克肟分散片、甲硝唑片等预防感染，并定期复查评估愈合情况。
若术后脓液引流不彻底或创面反复感染，可能导致脓肿壁纤维化形成慢性瘘管，即肛瘘。肛瘘表现为肛门周围反复肿痛、流脓，需通过肛瘘切除术或挂线疗法等手术治疗。高风险人群包括糖尿病患者、免疫力低下者及未规范换药的患者。
术后应避免久坐久站，每日用温水坐浴1-2次促进血液循环，饮食以高纤维食物如燕麦、西蓝花为主预防便秘，禁止辛辣刺激食物。若出现发热、创面渗液增多或持续疼痛，须立即就医。术后1个月内避免剧烈运动，定期随访至创面完全愈合。