甲状腺乳头状癌通过规范治疗通常能实现临床治愈。治疗效果与肿瘤分期、病理类型、治疗方式等因素相关，早期患者预后较好。
甲状腺乳头状癌是分化型甲状腺癌中预后最好的类型，癌细胞生长缓慢且较少远处转移。手术切除是主要治疗手段，根据肿瘤大小和侵犯范围可选择甲状腺腺叶切除或全甲状腺切除。术后配合放射性碘治疗可清除残留病灶，降低复发概率。对于无淋巴结转移的微小癌，十年生存率超过95%。即使发生局部淋巴结转移，规范治疗后十年生存率仍可达90%。术后需长期服用左甲状腺素钠片抑制促甲状腺激素分泌，定期复查甲状腺功能和颈部超声。
少数患者可能出现肿瘤复发或远处转移，多见于初次手术不彻底或未规范接受放射性碘治疗的情况。复发灶可通过再次手术或放射性碘治疗控制，肺转移患者经综合治疗后仍有较好生存预期。未分化型甲状腺癌或合并其他高危病理类型的患者预后相对较差，需采取更积极的综合治疗方案。
甲状腺乳头状癌患者术后应保持均衡饮食，适当增加优质蛋白和维生素摄入，避免过量食用海带紫菜等高碘食物。规律作息和适度运动有助于增强免疫力，术后半年内避免颈部剧烈活动。严格遵医嘱服药并定期复查甲状腺功能，出现声音嘶哑、颈部肿块等异常症状及时就医。保持乐观心态，多数患者可获得长期高质量生存。