幽门螺杆菌治愈后存在复发概率，但复发率较低。复发可能与再次接触传染源、治疗不彻底、耐药菌株感染等因素有关。
幽门螺杆菌感染治愈后复发的主要原因是再次接触被污染的食物或水源。共用餐具、接吻等密切接触行为可能造成细菌传播。部分患者因治疗期间未严格遵医嘱完成全程用药，导致细菌未被完全清除。使用抗生素不规范可能诱导细菌产生耐药性，增加复发风险。胃黏膜防御功能下降或免疫缺陷患者更易发生重复感染。
极少数情况下，幽门螺杆菌可能通过医疗操作传播。内镜检查消毒不彻底可能成为传播途径。某些特殊菌株具有更强生存能力，在胃酸环境中可长期潜伏。家族聚集性感染者需注意共同生活成员的同步治疗。既往有消化性溃疡病史者复发时症状可能更明显。
预防复发需注意分餐制饮食，避免共用餐具水杯。家庭成员应同步检测治疗，减少交叉感染风险。定期复查碳13/14呼气试验有助于早期发现复发。保持规律作息与清淡饮食，限制辛辣刺激食物摄入。出现上腹疼痛、腹胀等不适症状时应及时就医复查。日常可适量补充益生菌维持肠道菌群平衡，但需与抗生素服用间隔2小时以上。