幽门螺杆菌治好后存在再次感染的可能性，但概率较低。幽门螺杆菌感染治愈后再次感染可能与饮食卫生、家庭共餐习惯、免疫力下降等因素有关。
幽门螺杆菌感染治愈后，若未改善共用餐具、接吻等密切接触行为，或长期处于卫生条件较差的饮食环境，可能通过粪-口或口-口途径再次感染。免疫功能低下人群如糖尿病患者、长期服用免疫抑制剂者，对病原体清除能力减弱，也可能增加再感染风险。规范治疗后需通过碳13/14呼气试验确认根除，若检测结果假阴性可能导致误判为再感染。部分菌株对克拉霉素、甲硝唑等抗生素耐药，若初次治疗未彻底杀灭耐药菌株，可能复发而非真正再感染。
再感染多发生于治疗完成后的前6-12个月，此后概率显著降低。儿童、经济欠发达地区居民因免疫系统未完善或卫生条件限制，再感染率稍高。使用公筷、餐具消毒、避免生食可有效阻断传播途径。根除治疗后建议每年复查呼气试验，胃部不适时及时检测。合并胃溃疡患者再感染可能加重黏膜损伤，需加强随访。
预防幽门螺杆菌再感染需建立长期健康管理策略，家庭成员应同步筛查治疗以避免交叉感染，日常饮食选择分餐制并高温消毒餐具，外出就餐优先使用一次性餐具，避免饮用未经煮沸的生水。适当补充益生菌如双歧杆菌可调节胃肠菌群平衡，减少病原体定植机会。保持规律作息与适度运动有助于维持免疫功能，胃部持续不适或反酸嗳气症状复发时，应及时进行幽门螺杆菌检测与胃镜检查。根除成功后仍建议每1-2年复查碳13呼气试验，高风险职业如幼教、医护工作者可缩短复查间隔。